過濾器裝置必須和樣品的化學性質*相容。一些過濾膜含有可能對一些應用造成干擾的無毒的潤濕劑。另一些濾膜可能結合蛋白質或其它大分子,從而導致過濾器過早堵塞或高價值樣品的損失。因此,了解樣品性質以及濾膜對與之接觸的溶液的潛在影響是非常重要的。
 
                                  |   |             醋酸纖維素CA |             尼龍NYLON |             聚醚砜PES |             混合纖維素MCE |             特氟龍PTFE |         
                    | 蛋白結合 |             非常低 |             低至中 |             非常低 |             低 |             不適用 |         
                    | DNA結合 |             非常低 |             非常低 |             非常低 |             低 |             不適用 |         
                    | 耐化學性 |             低 |             中至高 |             低 |             非常高 |             非常高 |         
    
聚醚砜(PES)
濾膜強烈推薦用于過濾細胞培養基。PES結合蛋白質的能力和可提取物含量都非常低。PES膜的流速也高于纖維素或尼龍膜。
 
醋酸纖維素酯膜(CA)
濾膜對多數大分子的結合親和力非常低,尤其適用于要求低蛋白結合作用的應用,例如含血清培養基的過濾。
 
尼龍膜(聚酰胺NYLON)
本質上是親水性的,推薦用于對可提取物含量要求非常低的應用,因為它們不含任何潤濕劑、清潔劑或表面活性劑。尼龍膜的耐化學性能較強,適于過濾腐蝕性較大的溶液,例如酒精和DMSO。
 
特氟龍(PEFE,聚四氟乙烯)
膜本質上并且永遠是疏水性的,適于過濾氣體,包括增濕的空氣。特氟龍膜的耐化學性佳,這使其非常適于過濾其它濾膜不能過濾的溶劑或其它腐蝕性化學品。由于其疏水性,特氟龍膜在過濾水性溶液以前必須用溶劑(例如乙醇)預先潤濕